home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Internet Surfer: Getting Started / Internet Surfer - Getting Started (Wayzata Technology)(7231)(1995).bin / pc / textfile / mac_faqs / graph / part2 < prev   
Internet Message Format  |  1995-01-27  |  63KB

  1. Xref: bloom-picayune.mit.edu comp.graphics:31802 news.answers:3599
  2. Newsgroups: comp.graphics,news.answers
  3. Path: bloom-picayune.mit.edu!enterpoop.mit.edu!snorkelwacker.mit.edu!ira.uka.de!news.belwue.de!math.fu-berlin.de!news.netmbx.de!Germany.EU.net!mcsun!pythia.csi.forth.gr!ntua.gr!theseas!nfotis
  4. From: nfotis@ntua.gr (Nick C. Fotis)
  5. Subject: (15 Oct 92) Computer Graphics Resource Listing : WEEKLY [part 2/2]
  6. Message-ID: <nfotis.719061557@theseas>
  7. Followup-To: poster
  8. Lines: 1397
  9. Reply-To: nfotis@theseas.ntua.gr (Nick (Nikolaos) Fotis)
  10. Organization: National Technical Univ. of Athens
  11. Date: Wed, 14 Oct 1992 11:19:17 GMT
  12. Approved: news-answers-request@MIT.Edu
  13.  
  14. Archive-name: graphics/resources-list/part2
  15. Last-modified: 1992/10/15
  16.  
  17.  
  18. Computer Graphics Resource Listing : WEEKLY POSTING [ PART 2/2 ]
  19. ===================================================
  20. Last Change : 15 Octomber 1992
  21.  
  22.  
  23. 15. Image analysis software - Image processing and display
  24. ----------------------------------------------------------
  25.  
  26. [ MAJOR reorganization + additions! ]
  27. [ Here I include a half baked list from ritley@uimrl7.mrl.uiuc.edu (Kenneth
  28.  Ritley) on such softare, plus additions from Stephen L. Pendergast's
  29.  <penderga@HAC2ARPA.HAC.COM> list, which was derived in turn from Tim Allen's
  30.  <tim.allen@dartmouth.edu> list -- phew!! and various other sources here and
  31.  there. Also I tried to make a major reorganization under the various platform
  32.  categories . Still don't know how to separate the Remote Sensing stuff
  33.  Any ideas?? -- nfotis ]
  34.  
  35. PC and Mac-based tools (multi-platform software)
  36. ======================
  37.  
  38. IMDISP
  39. ------
  40.   IMDISP Written at JPL and other NASA sites. Can do simple display,
  41.   enhancing, smoothing and so on. Works with the FITS and VICAR/PDS
  42.   data formats of NASA. Can read TIFF images, if you know their dimensions
  43.   [PC and Macs]
  44.  
  45. LabVIEW 2
  46. ---------
  47.   LabVIEW is used as a framework for image processing tools. It provides a
  48.   graphical programming environment using block diagram sketch is the
  49.   "program" with graphical elements representing the programming elements.
  50.   Hundreds of functions are already available and are connected using a
  51.   wiring tool to create the block diagram (program).  Functions that the
  52.   block diagrams represent include digital signal processing and
  53.   filtering, numerical analysis, statistics, etc.  The tool allows any
  54.   Virtual Instrument (VI, a software file that looks and acts like a real
  55.   laboratory instrument) to be used as a part of any other virtual
  56.   instrument.
  57.  
  58.   National Instruments markets plug-in digital signal processing (DSP)
  59.   boards for Macintoshs and PC compatables that allow real-time
  60.   acquisition and analysis at a personal computer.  New software tools for
  61.   DSP are allowing engineers to harness the power of this technology. The
  62.   tools range from low-level debugging software to high-level block
  63.   diagram development software.  There are three levels of DSP programming
  64.   associated with the NB-DSP2300 board and LabVIEW:
  65.   Use of the NB-DSP2300 Analysis Library: FFTs, power spectra, filters
  66.   routines callable from THINK C and Macintosh Programers Workshop (MPW) C
  67.   that execute on the NB-DSP2300 board. There is an analysis Virtual
  68.   Interface Library of ready-to-use VIs optimized for the NB-DSP2300.
  69.  
  70.   Use of the National Instruments Developers Toolkit that includes an
  71.   optimizing C compiler, an assembler and a linker for low-level
  72.   programming of the DSP hardware.  This approach offers the highest level
  73.   of performance but is the must difficult in terms of ease of use.
  74.  
  75.   Use of the National Instruments Interface Kit software package which has
  76.   utility functions for memory management data communications and
  77.   downloading code to the NB-DSP2300 board. (This is the easiest route for
  78.   the development of custom code.)
  79.  
  80. Ultimage Concept VI
  81. -------------------
  82.   Concept VI  by Graftek-France is a family of image processing Virtual
  83.   Instruments (VIs) that give LabVIEW 2 (described above) users high-end
  84.   tools for designing, integrating and monitoring imaging control systems.
  85.   A VI is a software file that looks and acts like a real laboratory
  86.   instrument. Typical applications for Concept VI include thermography,
  87.   surveillance, machine vision, production testing, biomedical imaging,
  88.   electronic microscopy and remote sensing.
  89.  
  90.   Ultimage Concept VI addresses applications which require further
  91.   qualitative and quantitative analysis.  It includes a complete set of
  92.   functions for image enhancement, histogram equalization, spatial and
  93.   frequency filtering, isolation of features, thresholding, mathematical
  94.   morphology analysis, density measurement, object counting, sizing and
  95.   characterization.
  96.  
  97.   The program loads images with a minimum resolution of 64 by 64, a pixel
  98.   depth of 8, 16, or 32 bits, and one image plane.  Standard input and
  99.   output formats include PICT, TIFF, SATIE, and AIPD.  Other formats can
  100.   be imported.
  101.  
  102.   Image enhancement features include lookup table transformations, spatial
  103.   linear and non-linear filters, frequency filtering, arithmetic and logic
  104.   operations, and geometric transformations, among others.  Morphological
  105.   transformations include erosion, dilation, opening, closing, hole
  106.   removal, object separation, and extraction of skeletons, among others.
  107.   Quantitative analysis provides for objects' detection, measurement, and
  108.   morphological distribution.  Measures include area, perimeter, center of
  109.   gravity, moment of inertia, orientation, length of relevant chords, and
  110.   shape factors and equivalence.  Measures are saved in ASCII format.  The
  111.   program also provides for macro scripting and integration of custom
  112.   modules.
  113.  
  114.   A 3-D view command plots a perspective data graph where image intensity
  115.   is depicted as mountains or valleys in the plot.  The histogram tool can
  116.   be plotted with either a linear or logarithmic scale. The twenty-eight
  117.   arithmetic and logical operations provide for: masking and averaging
  118.   sections of images, noise removal, making comparisons, etc.  There are
  119.   13 spatial filters that alter pixel intensities based on local
  120.   intensity.  These include high-pass filters for contrast and outlines.
  121.   The frequency data resulting from FFT analysis can be displayed as
  122.   either the (real , imaginary ) components or the (phase, magnitude)
  123.   data.  The morphological transformations are useful for data sharpening
  124.   and defining objects or for removing artifacts.
  125.  
  126.   The transformations include: thresholding, eroding, dilating and even
  127.   hole filling.
  128.  
  129.   The program's quantitative analysis measurements include: area,
  130.   perimeter, center of mass, object counts, and angle between points.
  131.  
  132.   GTFS, Inc. 2455 Bennett Valley Road #100C Santa Rosa, CA 95494
  133.   707-579-1733
  134.  
  135. IPLab Spectrum
  136. --------------
  137.   IPLAB Spectrum supports image processing and analysis but lacks the
  138.   morphology and quantitative analysis features provided by
  139.   Graftek-FranceUs Ultimage Concept VI.  Using scripting tools, the user
  140.   tells the system the operations to be performed. The problem is that far
  141.   too many basic operations require manual intervention. The tool
  142.   supports: FFTs, 16 arithmetic operations for pixel alteration, and a
  143.   movie command for cycling through windows.
  144.  
  145.  
  146. Macintosh-based tools
  147. =====================
  148.  
  149. NCSA Image, NCSA PalEdit and more
  150. ---------------------------------
  151.   NCSA provides a whole suite of public-domain visualization tools for the
  152.   Macintosh, primarily aimed at researchers wanting to visualize results
  153.   from numerical modelling calculations.  These applications,
  154.   documentation, and source code are available for anonymous ftp from
  155.   ftp.ncsa.uiuc.edu. Commercial versions of the NCSA programs have been
  156.   developed by Spyglass.
  157.  
  158.   Spyglass, Inc. 701 Devonshire Drive Champaign, IL  61820 (217) 355-6000
  159.   fax: 217 355 8925
  160.  
  161. NIH IMAGE
  162. ---------
  163.   Available at alw.nih.gov (128.231.128.7) or (preferably)
  164.   zippy.nimh.nih.gov [128.231.98.32], directory:/pub/image.
  165.   It has painting and image manipulation tools, a macro language,
  166.   tools for measuring areas, distances and angles, and for counting
  167.   things. Using a frame grabber card, it can record sequences of
  168.   images to be played back as a movie. It can invoke user-defined
  169.   convolution matrix filters, such as Gaussian. It can import raw
  170.   data in tab-delimited ASCII, or as 1 or 2-byte quantities. It also
  171.   does histograms and even 3-D plots. It is limited to 8-bits/pixel,
  172.   though the 8 bits map into a color lookup table. It runs on any Mac
  173.   that has a 256-color screen and a FPU (or get the NonFPU version
  174.   from zippy.nimh.nih.gov)
  175.  
  176. PhotoMac
  177. --------
  178.   Data Translation, Inc. 100 Locke Dr. Marlboro, MA 01752 508-481-3700
  179.  
  180. PhotoPress
  181. ----------
  182.   Blue Solutions 3039 Marigold Place Thousand Oaks, CA 91360 805-492-9973
  183.  
  184. PixelTools and TCL-Image
  185. ------------------------
  186.   "Complete family of PixelTools (hardware accelerator and applications
  187.   software) for scientific image processing and analysis.  Video-rate
  188.   capture, display, processing, and analysis of high-resolution
  189.   monochromatic and color images.  Includes C source code."
  190.  
  191. TCL-Image:
  192.   "Software package for scientific, quantitative image processing and
  193.   analysis. It provides a complete language for the capture, enhancement,
  194.   and extraction of quantitative information from gray-scale images.
  195.   TCL_Image has over 200 functions for image processing, and contains the
  196.   other elements needed in a full programming language for algorithm
  197.   development -- variables and control structures.  It is easily
  198.   extensible through "script" (or indirect command) files. These script
  199.   files are simply text files that contain TCL-Image commands.  They are
  200.   executed as normal commands and include the ability to pass parameters.
  201.   The direct capture of video images is supported via popular frame
  202.   grabber boards.  TCL-Image comes with the I-View utility that provides
  203.   conversion between common image file types, such as PICT2 and TIFF."
  204.  
  205.   Perceptics 725 Pellissippi Parkway Knoxville, TN 37933 615-966-9200
  206.  
  207. Satellite Image Workshop
  208. ------------------------
  209.   It comes with a number of satellite pictures (raw data) and does all
  210.   sorts of image enhancing on it. You'll need at least a Mac II with co-
  211.   processor; a 256 color display and a large harddisk. The program doesn't
  212.   run under system 7.x.ATE1 V1
  213.  
  214.   In the documentation the contact address is given as:  Liz Smith, Jet
  215.   Propulsion Laboratory, MS 300-323, 4800 Oak Grove Dr,.Pasadena, CA 91109
  216.   (818) 354-6980
  217.  
  218. Visualization Workbench
  219. -----------------------
  220.   "An electronic imaging software system that performs interactive image
  221.   analysis and scientific 2D and 3D plotting."
  222.  
  223.   Paragon Imagine 171 Lincoln St. Lowell, MA 01852 508-441-2112
  224.  
  225. Adobe Photoshop
  226. ---------------
  227.  
  228.   The tool supports Rtrue colorS with 24-bit images or 256 levels of grey
  229.   scale.  Once an image has been imported it can be Rre-touchedS with
  230.   various editing tools typical of those used in Macintosh-based RpaintS
  231.   applications.  These include an eraser, pencil, brush and air brush.
  232.   Advanced RpasteS tools that control the interaction between a pasted
  233.   selection and the receiving site have also been incorporated.  For
  234.   example, all red pixels in a selection can easily be preventing from
  235.   being pasted. Photoshop has transparencies ranging from 0 to 100%,
  236.   allowing you to create ghost overlays.  RPhoto-editingS tools include
  237.   control of the brightness and contrast, color balancing, hue/saturation
  238.   modification and spectrum equalization.  Images can be subjected to
  239.   various signal processing algorithms to smooth or sharpen the image,
  240.   blur edges, or locate edges.  Image scaling is also supported.
  241.  
  242.   For storage savings, the images can be compressed using standard
  243.   algorithms, including externally supplied compression such as JPEG,
  244.   availlable from Storm Technologies. The latest version of Adobe
  245.   Photoshop supports the import of numerous image formats including: EPSF,
  246.   EPSF, TIFF, PICT resource, Amiga IFF/ILBM, CompuServe GIF, MacPaint,
  247.   PIXAR, PixelPaint, Scitex CT, TGA and ThunderScan..
  248.  
  249.   Adobe Systems, Inc. 1585 Charlestown Road PO Box 7900 Mountain View, CA
  250.   94039-7900 415-961-4400
  251.  
  252. ColorStudio and ImageStudio
  253. ---------------------------
  254.   ColorStudio is an image-editing and paint package from Letraset that has
  255.   more features than Adobe Photoshop but is decidedly more complex and
  256.   therefore more difficult to use.  Several steps are often required to
  257.   accomplish that which can be done in a single step using Photoshop.  The
  258.   application requires a great deal of available disk space as one can
  259.   easily end up with images in the 30 MB range.  The program provides a
  260.   variety of powerful selection tools including the "auto selection tool"
  261.   which lets the user choose image areas on the basis of color, close
  262.   hues, color range and mask.
  263.  
  264. ImageStudio: Don't know...
  265.  
  266.   Letraset USA 40 Eisenhower Drive Paramus, NJ 07653 201-845-6100
  267.  
  268. Dapple Systems
  269. --------------
  270.   "High resolution image analysis software provides processing tools to
  271.   work with multiple images, enhance and edit, and measure a variety of
  272.   global or feature parameters, and interpret the data."
  273.  
  274.   Dapple Systems, 355 W. Olive Ave, #100 Sunnyvale, CA 94086 408-733-3283
  275.  
  276. Digital Darkroom
  277. ----------------
  278.   The latest release of Digital Darkroom has five new selection and
  279.   editing tools for enhancing images. One such feature allows the user to
  280.   select part of an image simply by "painting" it. A new polyline
  281.   selection tool creates a selection tool for single pixel wide
  282.   selections.  A brush lets the operator "paint" with a selected portion
  283.   of the image. Note that this is not a true color image enhancement tool.
  284.   This tool should be used when the user intends to operate in grey-scale
  285.   images only.  It should be noted that Digital Darkroom is not as
  286.   powerful as either Adobe Photoshop or ColorStudio.
  287.  
  288.   Silicon Beach Software 9770 Carroll Ctr. Rd., Suite J San Diego, CA
  289.   92126 619-695-6956
  290.  
  291. Dimple
  292. ------
  293.   It  is compatible with system 6.05 and system 7.0 , requires Mac LC or
  294.   II series with 256 colours, with a recommended min of 6Mb of ram. It has
  295.   the capability of reading Erdas files. Functions include; image
  296.   enhancement, 3D and contour plots, image statistics, supervised and
  297.   unsupervised classification, PCA and other image transformations. There
  298.   is also a means (Image Operation Language or IOL) by which you can write
  299.   your own transformations. There is no image rectification, however
  300.   Dimple is compatable with MAPII. The latest version is 1.4 and it is in
  301.   the beta stage of testing. Dimple was initially developed as a teaching
  302.   tool and it is very good for this purpose."
  303.  
  304.   "Dimple  runs on a colour Macintosh.  It is a product still in its
  305.   development phase.. i.e. it doesn't have all the inbuilt features of
  306.   other packages, but is coming along nicely.  It has its own inbuilt
  307.   language for writing "programs" for processing an image, defining
  308.   convolution filters etc. Dimple is a full mac application with pull down
  309.   menus etc... It is unprotected software."
  310.  
  311.   Process Software Solutions, PO Box 2110, Wollongong, New South Wales,
  312.   Australia. 2500. Phone 61 42 261757  Fax 61 42 264190.
  313.  
  314. Enhance
  315. -------
  316.   Enhance has a RrulerS tool that supports measurements and additionally
  317.   provides angle data. The tool has over 80 mathematical filter
  318.   variations: "Laplacian, medium noise filter", etc.  Files can be saved
  319.   as either TIFF, PICT, EPSF or text (however EPSF files can't be imported).
  320.  
  321.   MicroFrontier 7650 Hickman Road Des Moines, IA  50322 515-270-8109
  322.  
  323. Image Analyst
  324. -------------
  325.   An image processing product for users who need to extract quantitative
  326.   data from video images.  Image Analyst lets users configure
  327.   sophisticated image processing and measurement routines without the
  328.   necessity of knowing a programming language.  It is designed for such
  329.   tasks at computing number and size of cells in images projected by video
  330.   cameras attached to microscopes, or enhancing and measuring distances in
  331.   radiographs.
  332.  
  333.   Image Analyst provides users with an array of field-proven video
  334.   analysis techniques that enable them to easily assemble a sequence of
  335.   instructions to enhance feature appearance; count objects; determine
  336.   density, shape, size, position, or movement; perform object feature
  337.   extraction; and conduct textural analysis automatically.  Image Analyst
  338.   works with either a framegrabber board and any standard video camera, or
  339.   a disk-stored image.
  340.  
  341.   Within minutes, without the need for programming, the Image Analyst user
  342.   can set up a process to identify and analyze any element of a image.
  343.   Measurements and statistics can be automatically or semi-automatically
  344.   generated from TIFF or PICT files or from captured video tape images.
  345.   Image Analyst recognizes items in images based on their size, shape and
  346.   position.  The tool provides direct support for the Data Translation and
  347.   Scion frame grabbers. A menu command allows for image capture from a VCR
  348.   video camera or other NTSC or PAL devices.
  349.  
  350.   There are 2 types of files, the image itself and the related Sequence
  351.   file that holds the processing, measurements and analysis that the user
  352.   defines.  Automated sequences are set up in Regions Of Interest (ROI)
  353.   represented by movable, sizable boxes atop the image.  Inside a ROI, the
  354.   program can find the distance between two edges, the area of a shape,
  355.   the thickness of a wall, etc.  Image Analyst finds the center, edge and
  356.   other positions automatically. The application also provides tools so
  357.   that the user can work interactively to find the edge of object. It also
  358.   supports histograms and a color look-up table (CLUT) tool.
  359.  
  360.   Automatix, Inc. 775 Middlesex Turnpike Billerica, MA 01821 508-667-7900
  361.  
  362. IPLab
  363. -----
  364.   Signal Analytics Corp. 374 Maple Ave. E Vienna, VA  22180 703-281-3277
  365.   FAX 703-281-2509
  366.  
  367.   "Menu-driven image processing software that supports 24-bit color or
  368.   pseudocolor/grayscale image display and manipulation."
  369.  
  370. MAP II
  371. ------
  372.   Among the Mac GIS systems, MAP II distributed by John Wiley has
  373.   integrated image analysis.
  374.  
  375. IMAGE
  376. -----
  377.   from Stanford : Try anonymous ftp from sumex-aim.stanford.edu
  378.   It has pd source for image v2, and ready to run code for a mac under
  379.   image v3.
  380.  
  381.  
  382.  
  383. Windows/DOS PC-based tools
  384. ==========================
  385.  
  386. CCD
  387. ---
  388.   Richard Berry's CCD imaging book for Willamon-Bell contains (optional?)
  389.   disks with image manipulating software.  Source code is included.
  390.  
  391. ERDAS
  392. -----
  393.   "ERDAS will do all of the things you want:  rectification,
  394.   classification, transformations (canned & user-defined), overlays,
  395.   filters, contrast enhancement, etc. ... I was using it on my thesis &
  396.   then changed the topic a bit & that work became secondary."
  397.  
  398.   ERDAS, Inc. 2801 Buford Highway Suite 300 Atlanta, GA 30329 404-248-9000
  399.   FAX   404-248-9400
  400.  
  401. RSVGA
  402. -----
  403.   "I have been getting up to speed on a program called RSVGA available from
  404.   Eidetic Digital Image Ltd. in British Columbia.  Its for IBM PC's or
  405.   clones, cheap (about $400) and does all the stuff Erdas does but is not
  406.   as fast or as powerful, though I have had only limited experience with
  407.   Erdas.  I have used RSVGA with 6 of 7 Landsat bands and it is a good
  408.   starter program except for the obtuse manual"
  409.  
  410. IMAGINE-32
  411. ----------
  412.   It's a 32 bit package [I suppose for PCs] called "Imagine32"
  413.   or "Image32" The program does a modest amount of image processing --add,
  414.   subtract, multiply, divide, display, and plot an x or y cut across the image.
  415.   It can also display a number of images simultaneously.
  416.   The company is CompuScope, in Santa Barbara, CA. 
  417.  
  418. PC Vista
  419. --------
  420.   It was announced in the 1989 August edition of PASP.  It is known to
  421.   be available from Mike Richmond, whose email addresses have been
  422.  
  423.     richmond@bllac.berkeley.edu
  424.     richmond@bkyast.berkeley.edu
  425.  
  426.   and his s-mail address is:
  427.  
  428.   Michael Richmond,Astronomy Department, Campbell Hall, Berkeley, CA 94720
  429.  
  430.   The latest version of PC-Vista, version 1.7, includes not only the source
  431.   code and help files, but also a complete set of executable programs and
  432.   a number of sample FITS images. If you do wish to use the source code,
  433.   you will need Microsoft C, version 5.0 or later; other compilers may work,
  434.   but will require substantial modifications.
  435.  
  436.   To receive the documentation and nine double-density (360K) floppies
  437.   (or three quad-density 3-1/2 inch floppies (1.44M) with everything on them,
  438.   just send a request for PC-Vista, together with your name and a US-Mail
  439.   address, to 
  440.  
  441.     Office of Technology Licensing
  442.     2150 Shattuck Ave., Suite 510
  443.     Berkeley, Ca. 94704
  444.  
  445.   Include a check (Traveller's Checks are fine) or purchase order for $150.00
  446.   in U.S. dollars, if your address is inside the continental U.S., or $165.00
  447.   otherwise, made out to Regents of the University of California
  448.   to cover duplication and mailing costs.
  449.  
  450.  
  451. SOFTWARE TOOLS
  452. --------------
  453.   It's a set of software "tools" put out by Canyon State
  454.   Systems and Software. They are not free, but rather cheap at about $30 I
  455.   heard. It will handle most all of the formats used by frame grabber
  456.   software. 
  457.  
  458. MIRAGE
  459. ------
  460.   It's image processing software written by Jim Gunn at the
  461.   Astrophysics Dept at Princeton. It will run on a PC among other platforms.
  462.   It is a Forth based system - i.e. a Forth language with many image
  463.   processing displaying functions built in. 
  464.  
  465. DATA TRANSLATION SOURCE BOOK
  466. ----------------------------
  467.   The Data Translation company in Massachusetts publishes a free book
  468.   containing vendors of data analysis hardware and software which is
  469.   compatible with Data Translation and other frame grabbers.
  470.   Surely you can find much more PC-related stuff in it.
  471.  
  472. MAXEN386
  473. --------
  474.   A couple of Canadians have written a program named MAXEN386 which does
  475.   maximum entropy image deconvolution. Their company is named Digital
  476.   Signal Processing Software, or something like that, and the software is
  477.   mentioned in an article in Astronomy Magazine, either Jan or Feb 92
  478.   (an article on CCD's vs film). 
  479.  
  480. JANDEL SCIENTIFIC (JAVA)
  481. ------------------------
  482.   Another software package (JAVA) is put out by Jandel Scientific. 
  483.   Jandel Scientific, 65 Koch Road, Corte Madera, CA 94925, (415) 924-8640,
  484.   (800) 874-1888.
  485.  
  486. Microbrian
  487. ----------
  488.   Runs on an MS dos platform and uses a 32 bit graphics card
  489.   (Vista), or an about to be released version will support a number of
  490.   super VGA cards.  Its a full blown remote sensed data processing
  491.   system.. It is menu driven (character based screen), but is does not use
  492.   a windowed user interface. Its is hardware protected with a dongle.
  493.   Mbrian = micro Barrier reef Image Anaysis System. It was developed by
  494.   CSIRO (Commonwealth Scientific & Industrial Organization) and is
  495.   marketed/ supported by:
  496.  
  497.   MPA Australia (51 Lusher Road, Croydon, Victoria
  498.   tel + 61 3 724 4488     fax  +61 3 724 4455)
  499.  
  500.   There are educational and commercial prices, but be prepared to set
  501.   aside $A10k for the first educational licence.  Subsequent ones come
  502.   cheaper (they need to!) It has installed sites worldwide.  It is widely
  503.   used at ANU.
  504.  
  505. MicroImage
  506. ----------
  507.   The remote sensing lab here at Dartmouth currently uses Terra-Mar's
  508.   MicroImage, on 486 PCs with some fancy display hardware.
  509.  
  510.   Terra-Mar Resource Information Services, Inc.
  511.  
  512.   1937 Landings Drive Mountain View, CA  94043 415-964-6900   FAX
  513.   415-964-5430
  514.  
  515. Unix-based tools
  516. ----------------
  517.  
  518. IRAF (Image Reduction and Analysis Facility)
  519. --------------------------------------------
  520.   Developed in the National Optical Astronomy Observatory, Kitt Peak AZ
  521.   It is free, you can ftp it from noao.edu and complement it with
  522.   STSDAS from stsci.edu. Email to iraf@noao.edu for more details.
  523.   Apparently this is one of the _de facto_ standards in the astronomical
  524.   image community. They issue a newsletter also.
  525.   They seem to support very well their users. Works with VMS also last
  526.   I heard, and practically has its own shell on top of the VMS/Unix shells.
  527.  
  528.   It's suggested that you get a copy of saoimage for display under X windows.
  529.   Very flexible/extendable  -- tons (literally 3 linear feet) of
  530.   documentation for the general user, skilled user, and programmer.
  531.  
  532. ALV
  533. ---
  534.   A Sun-specific image toolkit.  Version 2.0.6 posted to
  535.   comp.sources.sun on 11dec89.  Also available via email to
  536.   alv-users-request@cs.bris.ac.uk.
  537.  
  538. AIPS
  539. ----
  540.   contact aipsmail@nrao.edu -- astronomical image processing
  541.   system of the national radio astronomy observatory, Charlottesville, VA
  542.   -- software distributed by 9 track tape last time I ordered it -- I did
  543.   not find this package very useful -- tons of dense documentation -- very
  544.   old code -- I heard in one of our astronomy laboratories the package may
  545.   be rewritten completely in the near future -- major funding available.
  546.  
  547. LABOimage 3.1
  548. -------------
  549.   (version 4.0 soon for X11) It's written in C, and currently
  550.   runs on Sun 3/xxx, Sun 4/xxx (OS3.5, 4.0 and 4.0.3) under SunView.
  551.   The expert system for image segmentation is written in Allegro Common Lisp.
  552.   It was used on the following domains: computer science (image analysis), 
  553.   medicine, biology, physics. It is distributed free of charge (source code).
  554.   Available via anonymous FTP at ads.com (128.229.30.16), in
  555.   pub/VISION-LIST-ARCHIVE/SHAREWARE/LaboImage_3.1.tar.Z
  556.  
  557.   Contact: Prof. Thierry Pun, Computer Vision Group Computing Science Center,
  558.   U-Geneva 12, rue du Lac, CH-1207 Geneva SWITZERLAND
  559.   Phone : +41(22) 787 65 82; fax: +41(22) 735 39 05
  560.   E-mail: pun@cui.unige.ch  or pun@cgeuge51.bitnet
  561.  
  562.  
  563. Figaro
  564. ------
  565.   It was originally made for VMS, and can be obtained from
  566.   Keith Shortridge in Australia (ks@aaoepp.aao.gov.au)
  567.   and for Unix from Sam Southard at Caltech (sns@deimos.caltech.edu).
  568.   It's about 110Mbytes on a Sun.
  569.  
  570. KHOROS
  571. ------
  572.   Moved to the Scientific  Visualization category below
  573.  
  574. Vista
  575. -----
  576.   The "real thing" is available via anonymous ftp from lowell.edu. Email to
  577.   vista@lowell.edu for more details. Total size less than 20Mbytes.
  578.  
  579. DISIMP
  580. ------
  581.   (Device Independent Software for Image Processing) is a powerful
  582.   system providing both user friendliness and high functionality in
  583.   interactive times.
  584.  
  585.   Feature Description
  586.  
  587.   DISIMP incorporates a rich library of image processing utilities and
  588.   spatial data options. All functions can be easily accessed via the
  589.   DISIMP executive. This menu is modular in design and groups image
  590.   processes by their function. Such a logical structure means that
  591.   complicated processes are simply a progression through a series of
  592.   modules.
  593.  
  594.   Processes include image rectification, classification (unsupervised and
  595.   supervised), intensity transformations, three dimensional display and
  596.   Principal Component Analysis. DISIMP also supports the more simple and
  597.   effective enhancement techniques of filtering, band subtraction and
  598.   ratioing.
  599.  
  600.   Host Configuration Requirements
  601.  
  602.   Running on UNIX workstations, DISIMP is capable of processing the more
  603.   computational intensive techniques in interactive processing times.
  604.   DISIMP is available in both Runtime and Programmer's environments. Using
  605.   the Programmers environment, utilities can be developed for specific
  606.   applications programs.
  607.  
  608.   Graphics are governed by an icon-based Display Panel which allows quick
  609.   enhancments of a displayed image. Manipulations of Look Up Tables,
  610.   colour stretches, changes to histograms, zooming and panning can be
  611.   interactively driven through this control.
  612.  
  613.   A range of geographic projections enables DISIMP to integrate data of
  614.   image, graphic and textual types. Images can be rectified by a number of
  615.   coordinate systems, providing the true geographic knowledge essential
  616.   for ground truthing. Overlays of grids, text and vector data can be
  617.   added to further enhance referenced imagery.
  618.  
  619.   The system is a flexible package allowing users of various skill levels
  620.   to determine their own working environment, including the amount of help
  621.   required. DISIMP comes fully configured with no optional extras. The
  622.   purchase price includes all functionality required for professional
  623.   processing of remote sensed data.
  624.  
  625.   For further information, please contact:
  626.  
  627.   The Business Manager, CLOUGH Engineering Group Systems Division, 627
  628.   Chapel Street, South Yarra, Australia 3141. Telephone:  +61 3 825 5555
  629.   Fax:  +61 3 826 6463
  630.  
  631. Global Imaging Software
  632. -----------------------
  633.   "We use Global Imaging Software to process AVHRR data, from the dish to
  634.   the final display. Select a chunk of five band data from a pass,
  635.   automatic navigation, calibrate it to Albedo and Temp, convert that to
  636.   byte, register it to predesigned window, all relatively automatically
  637.   and carefree.
  638.  
  639.   It has no classification routines to speak of, but it isn't that
  640.   difficult to write your own with their programmer's module.
  641.  
  642.   Very small operation: one designs, one codes, one sells. Been around for
  643.   a number of years, sold to Weather Service and Navy.  Runs on HP9000
  644.   with HP-UX.  Supports 24-bit display"
  645.  
  646. HIPS
  647. ----
  648. (Human   Information   Processing Laboratory's Image Processing System)
  649.  
  650.   Michael Landy co-wrote and sell a general-purpose package for image
  651.   processing which has been used for basically all the usual image
  652.   processing applications (robotics, medical, satellite, engineering, oil
  653.   exploration, etc.).  It is called HIPS, and deals with sequences of
  654.   multiband images in the same way it deals with single images.  It has
  655.   been growing since we first wrote it, both by additions from us as well
  656.   as a huge user-contributed library.
  657.  
  658.   Feature description
  659.  
  660.   HIPS  is  a  set  of  image  processing  modules  which together provide
  661.   a  powerful  suite  of  tools  for  those interested in research,
  662.   system  development  and  teaching. It  handles  sequences  of  images
  663.   (movies)  in precisely the same manner as single frames.
  664.  
  665.   Programs and subroutines have been developed  for simple image
  666.   transformations, filtering, convolution, Fourier and other transform
  667.   processing, edge detection  and line  drawing   manipulation, digital
  668.   image compression and transmission  methods, noise generation, and image
  669.   statistics computation. Over 150 such  image transformation programs
  670.   have been developed.  As a result, almost any image processing  task
  671.   can be performed quickly and conveniently. Additionally, HIPS allows
  672.   users to easily integrate  their  own custom  routines.   New users
  673.   become effective using HIPS on their first day.
  674.  
  675.   HIPS features images that are  self-documenting.   Each image stored  in
  676.   the  system  contains  a  history  of the transformations that have been
  677.   applied to that image.   HIPS includes  a  small  set of subroutines
  678.   which primarily deals with a standardized  image sequence  header,  and
  679.   a  large library  of  image  transformation tools in the form of UNIX
  680.   ``filters''.  It comes complete with source  code,  on-line manual
  681.   pages, and on-line documentation.
  682.  
  683.   Host Configuration Requirements
  684.  
  685.   Originally  developed at  New  York  University,  HIPS  now represents
  686.   one of the most extensive and flexible vision and image  processing
  687.   environments currently available.  It runs under the UNIX operating
  688.   system.  It is modular  and  flexible, provides automatic documentation
  689.   of its actions, and is almost entirely independent of special equipment.
  690.   HIPS is now in use on a variety of computers including Vax and
  691.   Microvax, Sun, Apollo,  Masscomp,  NCR Tower, Iris, IBM AT, etc.
  692.   For image display and input, drivers are supplied for the Grinnell and
  693.   Adage (Ikonas) image processors, and the Sun-2, Sun-3, Sun- 4, and
  694.   Sun-386i consoles.  We also  supply  user-contributed drivers  for  a
  695.   number of  other framestores and windowing packages (Sun gfx, Sun
  696.   console, Matrox VIP-1024, ITI IP-512, Lexidata,  Macintosh II, X
  697.   windowing system, and Iris).  The Hipsaddon package includes an
  698.   interface  for the  CRS-4000. It  is  a  simple matter to interface HIPS
  699.   with other frame- stores, and we can put interested users in touch with
  700.   users who  have interfaced HIPS with the Arlunya and Datacube Max-
  701.   Video. HIPS can be easily adapted for other  image  display devices
  702.   because 98% of HIPS is machine independent.
  703.  
  704.   Availability
  705.  
  706.   HIPS has proven itself a highly flexible  system,  both as  an
  707.   interactive  research tool, and for more production- oriented tasks. It
  708.   is both easy to use, and quickly adapted and extended to new uses. HIPS
  709.   is supplied on magnetic tape in UNIX tar format (either reel- to-reel or
  710.   Sun  cartridge), and comes with source code, libraries, a library of
  711.   convolu- tion masks, and on-line documentation and manual pages.
  712.  
  713.   Michael Landy SharpImage Software P.O. Box 373, Prince Street Station
  714.   New York, NY   10012-0007 Voice:  (212) 998-7857 Fax: (212) 995-4011
  715.  
  716.  
  717. MIRA
  718. ----
  719.   Nothing known besides its name. Anyone to add here info?
  720.  
  721. ==========================================================================
  722.  
  723. 16. Image annotation software
  724. -----------------------------
  725.  
  726. a. Touchup runs in Sunview and is pretty good.  It reads in
  727.   rasterfiles, but even if your image isn't normally stored
  728.   in rasterfile format you could use screendump to make it a
  729.   rasterfile.
  730.  
  731. b. Idraw (part of Stanford's InterViews distribution) can handle some
  732.   image formats in addition to being a MacDraw like tool.  I'm not
  733.   sure exactly what they are.
  734.   You can ftp the idraw's binary from interviews.stanford.edu.
  735.  
  736. c. Tgif is another MacDraw like tool that can handle X11 bitmap (xbm)
  737.   and X11 pixmap (xpm) formats.  If the image you have is in formats
  738.   other than xbm or xpm, you can get the pbmplus toolkit to convert
  739.   things like gif or even some Macintosh formats to xpm.
  740.   Tgif's sources are available in the pub directory on cs.ucla.edu
  741.   (Version 2.12 of tgif at patchlevel 7 plus patch8 and patch9)
  742.  
  743. d. Use the editimage facility of KHOROS (see below).
  744.   This is just one utility in the overall system- you can essentially do all
  745.   your image processing and macdraw-type graphics using this package.
  746.  
  747. e. You might be able to get by with PBMPlus.  pbmtext gives you text output
  748.   bitmaps which can be overlaid on top of your image.
  749.  
  750. f. 'ice' requires Sun hardware running OpenWindows 3.It's a PostScript-based
  751.   graphical editor,and it's available for anonymous ftp from Internet host
  752.   eo.soest.hawaii.edu (128.171.151.12). Requires Sun C++ 2.0 and
  753.   two other locally developed packages, the LXT library (an Xlib-based
  754.   toolkit) and a small C++ class library. All files (pub/ice.tar.Z,
  755.   pub/lxt.tar.Z and pub/ldgoc++.tar.Z) are available in compressed
  756.   tar format. pub/ice.tar.Z contains a README that gives installation
  757.   instructions, as well as an extensive man page (ice.1).
  758.   A statically-linked compressed executable pub/ice-sun4.Z for
  759.   SPARC systems is also available for ftp.
  760.  
  761.   All software is the property of Columbia University and may not
  762.   be redistributed without permission.
  763.  
  764.   ice means Image Composition Environment and it's an imaging tool that
  765.   allows raster images to be combined with a wide variety of
  766.   PostScript annotations in WYSIWYG fashion via X11 imaging
  767.   routines and NeWS PostScript rasterizing.
  768.  
  769. g. Use ImageMagick to annotate an image from your X server.  Pick the 
  770.   position of your text with the cursor and choose your font and pen 
  771.   color from a pull-down menu.  ImageMagick can read and write many
  772.   of the more popular image formats.  ImageMagick is available as
  773.   export.lcs.mit.edu: contrib/ImageMagick.tar.Z or at your nearest
  774.   X11 archive.
  775.  
  776. ==========================================================================
  777.  
  778. 17. Scientific visualization stuff
  779. ----------------------------------
  780.  
  781. X Data Slice (xds)
  782. -------------------
  783.   Bundled with the X11 distribution from MIT,
  784.   in the contrib directory. Available at ftp.ncsa.uiuc.edu [141.142.20.50]
  785.   (either as a source or binaries for various platforms).
  786.  
  787. National Center for Supercomputing Applications (NCSA) Tool Suite
  788. -----------------------------------------------------------------
  789.  
  790. Platforms: Unix Workstations (DEC, IBM, SGI, Sun)
  791.            Apple MacIntosh 
  792.            Cray supercomputers
  793.  
  794. Availability: Now available.  Source code in the public domain.
  795.               FTP from ftp.ncsa.uiuc.edu.
  796.  
  797. Contact: National Center for Supercomputing Applications
  798.          Computing Applications Building
  799.          605 E. Springfield Ave.
  800.          Champaign, IL 61820
  801.         
  802. Cost: Free (zero dollars).
  803.  
  804. The suite includes tools for 2D image and 3D scene analysis and visualization.
  805. The code is actively maintained and updated.
  806.  
  807. KHOROS
  808. ------
  809.   Available via anonymous ftp at pprg.eece.unm.edu (129.24.24.10).
  810.   cd to /pub/khoros to see what is available. It is HUGE (> 100 MB), but good.
  811.   Needs Unix and X11R4. Freely copied (NOT PD), complete with sources
  812.   and docs. Very extensive and at its heart is visual programming.
  813.   Khoros components include a visual programming language, code
  814.   generators for extending the visual language and adding new application
  815.   packages to the system, an interactive user interface editor, an
  816.   interactive image display package, an extensive library of image and
  817.   signal processing routines, and 2D/3D plotting packages.
  818.  
  819.   See comp.soft-sys.khoros on Usenet and the relative FAQ for more info....
  820.  
  821.   Contact:
  822.  
  823.   The Khoros Group
  824.   Room 110 EECE Dept.
  825.   University of New Mexico
  826.   Albuquerque, NM 87131
  827.  
  828.   Email: khoros-request@chama.eece.unm.edu
  829.  
  830.  
  831. MacPhase
  832. --------
  833.   Analysis & Visualization Application for the Macintosh.
  834.   Operates on 1D and 2D data arrays. Import/Export several different file
  835.   formats.  Several different plotting options such as gray scale,
  836.   color raster, 3D Wire frame, 3D surface, contour, vector, line, and
  837.   combinations.  FFTs, filtering, and other math functions, color look up
  838.   editor, array calculator, etc. Shareware, available via anonymous ftp from
  839.   sumex-aim.stanford.edu in the info-mac/app directory.
  840.   For other information contact Doug Norton (e-mail: 74017.461@@compuserve.com)
  841.  
  842. IRIS Explorer
  843. -------------
  844.   It's an application creation system developed by Silicon
  845.   Graphics that provides visualisation and analysis functionality for
  846.   computational scientists, engineers and other scientists. The Explorer
  847.   GUI allows users to build custom applications without having to write
  848.   any, or a minimal amount of, traditonal code. Also, existing code can
  849.   be easily integrated into the Explorer environment. Explorer currently
  850.   is available now on SGI and Cray machines, but will become available on
  851.   other platforms in time. [ Bundled with every new SGI machine, as far as
  852.   I know]
  853.  
  854.   See comp.graphics.explorer for discussion of the package.
  855.   There are also two FTP servers for related stuff, modules etc.:
  856.  
  857.   ftp.epcc.ed.ac.uk [129.215.56.29]
  858.   swedishchef.lerc.nasa.gov [139.88.54.33] - mirror of the UK site
  859.  
  860. apE
  861. ---
  862.   Back in the 'old good days', you could get apE for nearly free.
  863.   Now has gone commercial and the following vendor supplies it:
  864.  
  865.   TaraVisual Corporation
  866.   929 Harrison Avenue
  867.   Columbus, Ohio 43215
  868.   Tel: 1-800-458-8731 and (614) 291-2912
  869.   Fax: (614) 291-2867
  870.  
  871.     Cost:
  872.   $895 (plus tax); runtime version with a site-license for a single user
  873.   (at a time), no limit on the number of machines in a cluster.
  874.   $895 includes support/maintenance and upgrades.
  875.   Source code more.  Additional user licenses $360.
  876.   The name of the package has become apE III (TM).
  877.   Khoros is very similar to apE on philosophy, as are AVS and Explorer.
  878.  
  879. AVS
  880. ---
  881. See also:
  882.     comp.graphics.avs
  883.  
  884. Platforms: CONVEX, CRAY, DEC, Evans & Sutherland, HP, IBM, Kubota,
  885. Set Technologies, SGI, Stardent, SUN, Wavetracer
  886. Availability: AVS3 available on all the above:
  887.   AVS4 currently available on SGI, SUN
  888.   AVS4 will be available on: HP, IBM, Kubota, SGI, Stardent, SUN
  889.   6/1/92
  890.  
  891. Contact:
  892.   Advanced Visual Systems Inc. for: CRAY, HP, IBM, SGI,
  893.   Stardent, SUN
  894.   CONVEX for CONVEX
  895.   Advanced Visual Systems Inc. or CRAY for CRAY
  896.   DEC for DEC
  897.   Evans & Sutherland for Evans & Sutherland
  898.   Advanced Visual Systems Inc. or IBM for IBM
  899.   Kubota Pacific Inc. for Kubota
  900.   Set Technologies for Set Technologies
  901.   Wavetracer for Wavetracer
  902.  
  903.  
  904. WIT
  905. ---
  906.   In a nutshell it's a package of the same genre as AVS,Explorer,etc.
  907.   It seems more a image processing system than a generic SciVi system (IMHO)
  908.   Major elements are:
  909.  
  910.   - a visual programming language, which automatically exploits the inherent
  911.     parallelism
  912.   - a ode generator which converts the graph to a standalone program
  913.  
  914.   Iconified libraries present a rich set of point, filter, io, transform,
  915.   morphological, segmentation, and measurement operations.
  916.   A flow library allows graphs to employ broadcast, merge,
  917.   synchronization, conditional, and sequencing control strategies.
  918.  
  919.   Users can easily extend WIT by defining new C functions, data types,
  920.   and servers to access specialized hardware.
  921.  
  922.   They are currently sending out free 3.5" demo disks suitable for Sun
  923.   Sparcstation floppy drives to anyone interested in trying out the
  924.   software (and they are thinking about putting a copy of the demo for
  925.   FTP).
  926.   Or you can try the Catalyst CDware program as trial software;
  927.   Demo version on Sun CDware 4.
  928.  
  929.   WIT supports Sun3, Sun4, vxWorks by Wind River Systems,
  930.   and Datacube (MaxVideo-20 hardware) platforms.
  931.  
  932.   Pricing: WIT for Sparc, one yr. free upgrades, 30 days
  933.   technical support....................$5000 US
  934.  
  935.   Academic institutions: discounts available
  936.  
  937.   Contact:
  938.   Logical Vision, Ltd.
  939.   6882 Rupert St.
  940.   Vancouver, B.C., Canada
  941.   V5S 2Z6
  942.   Tel: 604-435-2587, Fax: 604-299-8263
  943.   Terry Arden <poon@ee.ubc.ca>
  944.  
  945. VIS-5D 
  946. ------
  947.   A system for visually exploring the output of weather
  948.   models and similar data sets. Platforms:
  949.     SGI Power/VGX, Power/GTX and PI, Crimson and Indigo;
  950.     IBM RS/6000 with GL graphics;
  951.     Stardent GS-1000 and GS-2000
  952.   You can get it freely (thanks to NASA support) via anonymous ftp:
  953.  ftp vis5d.ssec.wisc.edu  (or ftp 144.92.108.66), then
  954.  
  955.   ftp> cd pub/vis5d
  956.   ftp> ascii
  957.   ftp> get README
  958.   ftp> bye
  959.  
  960.   Read section 2 of the README file for full instructions
  961.   on how to get and install VIS-5D.
  962.  
  963.   Contact:
  964.   Bill Hibbard (whibbard@vms.macc.wisc.edu)
  965.   Brian Paul (bpaul@vms.macc.wisc.edu)
  966.  
  967. DATAexplorer (IBM)
  968. ------------------
  969.   Platforms : IBM Risc System 6000, IBM POWER Visualization Server
  970.     (SIMD mesh 32 i860s, 40 MHz)
  971.  
  972.   Working on (announced) : SGI, HP, Sun
  973.  
  974.   Contact: 
  975.   Your local IBM Rep.  For a trial package ask your rep to contact :
  976.  
  977.   David Kilgore
  978.   Data Explorer Product Marketing
  979.   YKTVMH(KILCORE), (708) 981-4510
  980.  
  981. Wavefront
  982. ---------
  983.   Data Visualizer, Personal Visualizer, Advanced Visualizer.
  984.   Platforms: SGI, SUN, IBM RS6000, HP, DEC
  985.  
  986.   Availability:
  987.     Available on all the above platforms from Wavefront
  988.     Technologies.  Educational programs and site licenses are
  989.     available.
  990.  
  991.   Contacts:
  992.     Mike Wilson (mike@wti.com)
  993.  
  994.     Wavefront Technologies, Inc.
  995.     530 East Montecito Street
  996.     Santa Barbara, CA 93103
  997.     805-962-8117
  998.     FAX: 805-963-0410
  999.  
  1000.     Wavefront Europe
  1001.     Guldenspoorstraat 21-23
  1002.     B-9000 Gent, Belgium
  1003.     32-91-25-45-55
  1004.     FAX: 32-91-23-44-56
  1005.  
  1006.     Wavefront Technologies Japan
  1007.     17F Shinjuku-sumitomo Bldg
  1008.     2-6-1  Nishi-shinjuku, Shunjuku-Ku
  1009.     Tokyo 168 Japan
  1010.     81-3-3342-7330
  1011.     FAX 81-3-3342-7353
  1012.  
  1013.  
  1014. PLOT3D and FAST from NASA Ames
  1015. ------------------------------
  1016.   These packages are distributed from COSMIC at least
  1017.   (for FAST ask Pat Elson <pelson@nas.nasa.gov> for
  1018.   distribution information). In general, these codes are for US
  1019.   citizens only :-(
  1020.  
  1021. XGRAPH
  1022. ------
  1023.   On the contrib tape of X11R5. Its specialty is display of up
  1024.   to 64 data sets (2D).
  1025.  
  1026. NCAR
  1027. ----
  1028.   National Center for Atmospheric Research [ Anyone to add more info? ]
  1029.  
  1030. IDL/PV-WAVE
  1031. -----------
  1032.   "The IDL/PV-WAVE software package is what I currently use .
  1033.   I/O is very simple (a major plus!!) & most of my
  1034.   programming is very short & sweet.  Numerous output formats are
  1035.   available.  there are certainly some minuses & it does require
  1036.   "programming".  I use the command line version, though the "point &
  1037.   click" version is available...I have some acquaintances who use it on
  1038.   the Mac (I think via Mac-X).  Basically, there are a lot of built-in
  1039.   functions, though some manipulation is required.  IDL/PV-WAVE is able to
  1040.   work with any type of imagery. IDL runs on a unix system"
  1041.  
  1042. IDL/SIPS
  1043. --------
  1044.   A lot of people are using IDL with a package called SIPS. This was
  1045.   developed at the University of Colorado (Boulder) by some people working
  1046.   for Alex Goetz.  You might try contacting them if you already have IDL
  1047.   or would be willing to buy it.  It's a few thousand dollars (American) I
  1048.   expect for IDL and the other should be free.  Those are the general
  1049.   purpose packages I've heard of, besides what TerraMar has.
  1050.   SIPS _was_ written for AVIRIS imagery.  I'm not sure how general purpose
  1051.   it is.  You would have to contact Goetz or one of his people and ask.  I
  1052.   have another piece of software (PCW) that does PC and Walsh
  1053.   transformations with pseudocoloring and clustering and limited image
  1054.   modification (you can compute an image using selected components).  I've
  1055.   used it on 70 megabyte AVIRIS images without problems, but for the best
  1056.   speed you need an external DSP card.  It will work without it, but large
  1057.   images take quite a while (50-70 times as long) to process.  That's a
  1058.   freebie if you want it.
  1059.  
  1060.   My  favorite is IDL (Interactive Data Language) from Research Systems,
  1061.   Inc.  IDL is in my opinion, much better and infinitely easier. Its
  1062.   programming language is very strong and easy -- very Pascal-like. It
  1063.   handles the number-crunching very well, also. Personally, I like doing
  1064.   the number-crunching with IDL on the VAX (or Mathematica, Igor, or even
  1065.   Excel on the Mac if it's not too hairy), then bringing it over to NIH
  1066.   Image for the imaging part. I have yet to encounter any situation which
  1067.   that combination couldn't handle, and the speed and ease of use
  1068.   (compared to IRAF) was incredible. By the way, it's mostly astronomical
  1069.   image processing which I've been doing. This means image enhancement,
  1070.   cleaning up bad lines/pixels, and some other traditional image
  1071.   processing routines. Then, for example, taking a graph of intensity
  1072.   versus position along a line I choose with the mouse, then doing a curve
  1073.   fit to that line (which I might do like in KaleidaGraph.)
  1074.  
  1075. [ For IDL call Research Systems , for PV-WAVE call Precision Visuals and
  1076.  for SIPS call University of Colorado @ Boulder . From what I can
  1077.  understand, you can get packaged programs from Research Systems, though
  1078.  -- nfotis ]
  1079.  
  1080. Visual3
  1081. -------
  1082.   contact Robert Haimes, MIT
  1083.  
  1084. FieldView
  1085. ---------
  1086.   Intelligent Light Corp.
  1087.  
  1088.  
  1089. ==========================================================================
  1090.  
  1091. 18. Molecular visualization stuff
  1092. ---------------------------------
  1093.  
  1094. [ Based on a list from cristy@dupont.com < Cristy > , which asked for
  1095.  systems for displaying Molecular Dynamics, MD for short ]
  1096.  
  1097. Flex
  1098. ----
  1099.   It is a public domain package written by Michael Pique, at The Scripps
  1100.   Research Institute, La Jolla, CA. Flex is stored as a compressed,
  1101.   tar'ed archive (about 3.4MB) at perutz.scripps.edu [137.131.152.27], in
  1102.   pub/flex. It displays molecular models and MD trajectories.
  1103.  
  1104. MacMolecule
  1105. -----------
  1106.   (for Macintosh). I searched with Archie, and the most
  1107.   promising place is sumex-aim.stanford.edu (info-mac/app, and
  1108.   info-mac/art/qt for a demo)
  1109.  
  1110. MD-DISPLAY
  1111. ----------
  1112.   Runs on SGI machines. Call Terry Lybrand (lybrand@milton.u.washington.edu).
  1113.  
  1114. XtalView
  1115. --------
  1116.   It is a crystallography package that does visualize molecules and much more.
  1117.   It uses the XView toolkit.
  1118.   Call Duncan McRee <dem@scripps.edu>
  1119.  
  1120. landman@hal.physics.wayne.edu:
  1121. -----------------------------
  1122.   I am writing my own visualization code right now.  I look at MD output
  1123.   (a specific format, easy to alter for the subroutine) on PC's.  My
  1124.   program has hooks into GKS.  If your friend has access to Phigs for X
  1125.   (PEX) and fortran bindings, I would be happy to share my evolving code
  1126.   (free of charge).  Right now it can display supercells of up to 65
  1127.   atoms (easy to change), and up to 100 time steps, drawing nearest
  1128.   neighbor bonds between 2 defining nn radii.  It works acceptably fast
  1129.   on a 10Mhz 286.
  1130.  
  1131. icsg0001@caesar.cs.montana.edu:
  1132. ------------------------------
  1133.   I did a project on Molecular Visualization for my Master's Thesis, using
  1134.   UNIX/X11/Motif which generates a simple point and space-filling model.
  1135.  
  1136. KGNGRAF
  1137. -------
  1138.  
  1139. KGNGRAF is part of MOTECC-91. Look on malena.crs4.it (156.148.7.12),
  1140. in pub/motecc.
  1141.  
  1142. motecc.info.txt          Information about MOTECC-91 in plain ascii format.
  1143. ----------------------------------------------------------------------------
  1144. motecc.info.troff        Information about MOTECC-91 in troff format.
  1145. motecc.form.troff        MOTECC-91 order form in troff format.
  1146. motecc.license.troff     MOTECC-91 license agreement in troff format.
  1147. ----------------------------------------------------------------------------
  1148. motecc.info.ps           Information about MOTECC-91 in PostScript format.
  1149. motecc.form.ps           MOTECC-91 order form in PostScript format.
  1150. motecc.license.ps        MOTECC-91 license agreement in PostScript format.
  1151.  
  1152.  
  1153. ditolla@itnsg1.cineca.it:
  1154. ------------------------
  1155.   I'm working on molecular dynamic too.  A friend of mine and I have
  1156.   developed a program to display an MD run dynamically on Silicon
  1157.   Graphics.  We are working to improve it, but it doesn't work under X,
  1158.   we are using the graphi. lib. of the Silicon Gr. because they are much
  1159.   faster then X.  When we'll end it we'll post on the news info about
  1160.   where to get it with ftp. (Will be free software).
  1161.  
  1162. XBall V2.0
  1163. ----------
  1164.   Written by David Nedde. Call daven@maxine.wpi.edu.
  1165.  
  1166. XMol
  1167. ----
  1168.   An X Window System program that uses OSF/Motif  for  the
  1169.   display and  analysis  of  molecular  model data.  Data from several
  1170.   common file formats can be read and written; current formats include:
  1171.   Alchemy, CHEMLAB-II, Gaussian, MOLSIM, MOPAC, PDB, and MSCI's XYZ
  1172.   format (which has been designed  for  simplicity  in  translating to
  1173.   and from other formats). XMol also allows for conversion between
  1174.   several of these formats.
  1175.   Xmol is available at ftp.msc.edu. Read pub/xmol/README for
  1176.   further details.
  1177.  
  1178. INSIGHT II
  1179. ----------
  1180.   from BIOSYM Technologies Inc.
  1181.  
  1182. SCARECROW
  1183. ---------
  1184.   The program has been published in J. Molecular Graphics 10
  1185.   (1992) 33. The program can analyze and display CHARMM, DISCOVER, YASP
  1186.   and MUMOD trajectories. The program package contains also software for
  1187.   the generation of probe surfaces, proton affinity
  1188.   surfaces and molecular orbitals from an extended Huckel program.
  1189.   It works on Silicon Graphics machines.
  1190.   Contact Leif Laaksonen <Leif.Laaksonen@csc.fi or laaksone@csc.fi>
  1191.  
  1192. [ I would also suggest looking at least in SGI's Applications Directory.
  1193.  It contains many more packages - nfotis ]
  1194.  
  1195. ==========================================================================
  1196.  
  1197. 19. GIS (Geographical Information Systems software)
  1198. ---------------------------------------------------
  1199.  
  1200. [ I wish to put under this title and the mainly Remote Sensing software that's
  1201.  presently under Subject
  1202.  15: Image analysis software - Image processing and display . Any ideas?? ]
  1203.  
  1204.  
  1205. GRASS
  1206. -----
  1207.   (Geographic Resource Analysis Support System) of the US Army
  1208.   Construction Engineering Research Lab (CERL). It is a popular geographic and
  1209.   remote sensing image processing package. Many may think of GRASS as a
  1210.   Geographic Information System rather than an Image Processing package,
  1211.   although it is reported to have significant image processing
  1212.   capabilities.
  1213.  
  1214.   Feature Descriptions
  1215.  
  1216.   I use GRASS  because it's public domain and can be obtained through the
  1217.   internet for free.  GRASS runs in Unix and is written in C.  The source
  1218.   code can be obtained through an anonymous ftp from the Office of Grass
  1219.   Integration.  You then compile the source code for your machine, using
  1220.   scripts provided with GRASS.  I would recommend GRASS for someone who
  1221.   already has a workstation and is on a limited budget. GRASS is not very
  1222.   user-friendly, compared to Macintosh software." A first review  of
  1223.   overview documentation indicates that it looks useful and has some pixel
  1224.   resampling functions not in other packages plus good general purpose
  1225.   image enhancement routines (fft). Kelly Maurice at Vexcel Corp. in
  1226.   Boulder, CO is a primary user of GRASS .  This gentleman has used the
  1227.   GRASS software and developed multi-spectral (238 bands ??) volumetric
  1228.   rendering, full color, on Suns and Stardents. It was a really effective
  1229.   interface.  Vexcel Corp. currently has a contract to map part of Venus
  1230.   and convert the Magellan radar data into contour maps. You can call them
  1231.   at (303) 444-0094 or email care of greg@vexcel.com 192.92.90.68
  1232.  
  1233.   Host Configuration Requirements
  1234.  
  1235.   If you are willing to run A/UX you could install GRASS   on a Macintosh
  1236.   which has significant image analysis and import capabilities for
  1237.   satellite data. GRASS  is public-domain, and can run on a high-end PC
  1238.   under UNIX. It is raster-based, has some image-processing capability,
  1239.   and can display vector data (but analysis must be done in the raster
  1240.   environment). I have used GRASS V.3 on a SUN workstation and found it
  1241.   easy to use. It is best, of course, for data that are well represented
  1242.   in raster (grid-cell) form.
  1243.  
  1244.   Availability
  1245.  
  1246.   CERL's Office of Grass Integration (OGI)  maintains an ftp server:
  1247.   moon.cecer.army.mil (129.229.20.254).
  1248.  
  1249.   Connections are only allowed during off- peak hours (weekends and
  1250.   weekdays before 8:00 A.M. and after 5:00 P.M. Central Standard time).
  1251.   Mail regarding this site should be addressed to
  1252.   grass-ftp-admin@moon.cecer.army.mil.
  1253.  
  1254.   This location will be the new "canonical" source for GRASS software, as
  1255.   well as bug fixes, contributed sources, documentation, and other files.
  1256.   This FTP server also supports dynamic compression and uncompression and
  1257.   "tar" archiving of files.  A feature attraction of the server is John
  1258.   Parks' GRASS tutorial.  Because the manual is still in beta-test stage,
  1259.   John requests that people only acquire it if they are willing to review
  1260.   it and mail him comments/corrections. The OGI is not currently
  1261.   maintaining this document, so all correspondence about it should be
  1262.   directed to grassx@tang.uark.edu
  1263.  
  1264.   Support
  1265.  
  1266.   Listserv mailing lists:
  1267.  
  1268.   grassu-list@amber.cecer.army.mil (for GRASS users; application-level
  1269.   questions, support concerns, miscellaneous questions, etc) Send
  1270.   subscribe commands to grassu-request@amber.cecer.army.mil.
  1271.  
  1272.   grassp-list@amber.cecer.army.mil (for GRASS programmers; system-level
  1273.   questions and tips, tricks, and techniques of design and implementation
  1274.   of GRASS applications) Send subscribe commands to
  1275.   grassp-request@amber.cecer.army.mil.
  1276.  
  1277.   Both lists are maintained by the Office of Grass Integration (subset of
  1278.   the Army Corps of Engineers Construction Engineering Research Lab in
  1279.   Champaign, IL). The OGI is providing the lists as a service to the
  1280.   community; while OGI and CERL employees will participate in the lists,
  1281.   we can make no claim as to content or veracity of messages that pass
  1282.   through the list.  If you have questions, problems, or comments, send
  1283.   E-mail to lists-owner@amber.cecer.army.mil and a human will respond.
  1284.  
  1285. Microstation Imager
  1286. -------------------
  1287.   Intergraph (based in Huntsville Alabama) sells a wide range of GIS
  1288.   software/hardware. Microstation is a base  graphics package that Imager
  1289.   sits on top of. Imager is basically an  image processing package with a
  1290.   heavy GIS/remote sensing flavor.
  1291.  
  1292.   Feature Description
  1293.  
  1294.   Basic geometry manipulations: flip, mirror, rotate, generalized affine.
  1295.   Rectification: Affine, 2nd, 3rd, 4th and 5th order models as well as a
  1296.   projective model (warp an image to a vector map or to another image).
  1297.   RGB to IHS and IHS to RGB conversion.  Principal component analysis.
  1298.   Classification: K-means and isodata.  Fourier Xforms: Forward, filtering
  1299.   and reverse.  Filters: High pass, low pass, edge enhancing, median,
  1300.   generic.  Complex Histogram/Contrast control.  Layer Controller: manages
  1301.   up to 64 images at a time -- user can extract single bands from a 3 band
  1302.   image or create color images by combining various individual bands, etc.
  1303.  
  1304.   The package is designed for a remote sensing application (it can handle
  1305.   VERY LARGE images) and there is all kinds of other software available
  1306.   for GIS applications.
  1307.   Host Configuration Requirements
  1308.  
  1309.   It runs on Intergraph Workstations (a Unix machine similar to a Sun)
  1310.   though there  were rumors (there are always rumors) that the software
  1311.   would be  ported to PC and possibly a Sun environment.
  1312.  
  1313. PCI
  1314. ---
  1315.   A company called PCI, Inc., out of Richmond Hill, Ontario, Canada, makes
  1316.   an array of software utilities for processing, manipulation, and use of
  1317.   remote sensing data in eight or ten different "industry standard"
  1318.   formats: LGSOWG, BSQ, LANDSAT, and a couple of others whose titles I
  1319.   forget.  The software is available in versions for MS-DOS, Unix
  1320.   workstations (among them HP, Sun, and IBM), and VMS, and quite possibly
  1321.   other platforms by now.  I use the VMS version.
  1322.  
  1323.   The "PCI software" consists of several classes/groups/packages of
  1324.   utilities, grouped by function but all operating on a common "PCI
  1325.   database" disk file.  The "Tape I/O" package is a set of utility
  1326.   programs which read from the various remote-sensing industry tape
  1327.   formats INTO, or write those formats out FROM, the "PCI database" file;
  1328.   this is the only package I use or know much about.  Other packages can
  1329.   display data from the PCI database to one or another of several
  1330.   PCI-supported third-party color displays, output numeric or bitmap
  1331.   representation of image data to an attached printer, e.g. an Epson-type
  1332.   dot-matrix graphics printer.  You might be more spe- cifically
  1333.   interested in the mathematical operations package: histo- gram and
  1334.   Fourier analysis, equalization, user-specified operations (e.g.
  1335.   "multiply channel 1 by 3, add channel 2, and store as channel 5"), and
  1336.   God only knows what all else -- there's a LOT.  I don't have and don't
  1337.   use these, so can't say much about them; you only buy the packages your
  1338.   particular application/interest calls for.
  1339.  
  1340.   Each utility is controlled by from one to eight "parameters," read from
  1341.   a common "parameter file" which must be (in VMS anyway) in your "default
  1342.   directory."  Some utilities will share parameters and use the same
  1343.   parameter for a different purpose, so it can get a bit confusing setting
  1344.   up a series of operations.  The standard PCI environment contains a
  1345.   scripting language very similar to IBM-PC BASIC, but which allows you to
  1346.   automate the process of setting up parameters for a common, complicated,
  1347.   lengthy or difficult series of utility executions.  (In VMS I can also
  1348.   invoke utilities independently from a DCL command procedure.)  There's
  1349.   also an optional programming library which allows you to write compiled
  1350.   language programs which can interface with (read from/write to) the PCI
  1351.   data structures (database file, parameter file).
  1352.  
  1353.   The PCI software is designed specifically for remote-sensing images, but
  1354.   requires such a level of operator expertise that, once you reach the
  1355.   level where you can handle r-s images, you can figure out ways to handle
  1356.   a few other things as well.  For instance, the Tape I/O package offers a
  1357.   utility for reading headerless multi-band (what Adobe PhotoShop on the
  1358.   Macintosh calls "raw") data from tape, in a number of different
  1359.   "interleave" orders. This turns out to be ideal for manipulating the
  1360.   graphic-arts industry's "CT2T" format, would probably (I haven't tried)
  1361.   handle Targa, and so on. Above all, however, you HAVE TO KNOW WHAT
  1362.   YOU'RE DOING or you can screw up to the Nth degree and have to start
  1363.   over.  It's worth noting that the PCI "database" file is designed to
  1364.   contain not only "raster" (image) data, but vectors (for overlaying map
  1365.   information entered via digitizing table), land-use, and all manner of
  1366.   other information (I observe that a remote-sensing image tape often
  1367.   contains all manner of information about the spectral bands, latitude,
  1368.   longitude, time, date, etc. of the original satellite pass; all of this
  1369.   can go into the PCI "database").
  1370.  
  1371.   I _believe_ that on workstations the built-in display is used.  On VAX
  1372.   systems OTHER than workstations PCI supports only a couple of specific
  1373.   third-party display systems (the name Gould/Deanza seems to come to
  1374.   mind).  One of MY personal workarounds was a display program which would
  1375.   display directly from a PCI "database" file to a Peritek VCT-Q (Q-bus
  1376.   24-bit DirectColor) display subsystem.  PCI software COULD be "overkill"
  1377.   in your case; it seems designed for the very "high end"
  1378.   applications/users, i.e. those for whom a Mac/PC largely doesn't suffice
  1379.   (although as you know the gap is getting smaller all the time).  It's
  1380.   probably no coincidence that PCI is located in Canada, a country which
  1381.   does a LOT of its land/resource management via remote sensing; I believe
  1382.   the Canadian government uses PCI software for some of its work in these
  1383.   areas.
  1384.  
  1385. SPAM (Spectral Analysis Manager)
  1386. --------------------------------
  1387.   Back in 1985 JPL developed something called SPAM (Spectral Analysis
  1388.   Manager) which got a fair amount of use at the time.  That was designed
  1389.   for Airborne Imaging Spectrometer imagery (byte data, <= 256 pixels
  1390.   across by <= 512 lines by <= 256 bands); a modified version has since
  1391.   been developed for AVIRIS (Airborne VIsual and InfraRed Imaging
  1392.   Spectrometer) which uses much larger images.
  1393.  
  1394.   Spam does none of these things (rectification, classification, PC and
  1395.   IHS transformations, filtering, contrast enhancement, overlays).
  1396.   Actually, it does limited filtering and contrast enhancement
  1397.   (stretching).  Spam is aimed at spectral identification and clustering.
  1398.  
  1399.   The original Spam uses X or SunView to display.  The AVIRIS version may
  1400.   require VICAR, an executive based on TAE, and may also require a frame
  1401.   buffer.  I can refer you to people if you're interested.  PCW requires X
  1402.   for display.
  1403.  
  1404. MAP II
  1405. ------
  1406.   Among the Mac GIS systems, MAP II is distributed by John Wiley.
  1407.  
  1408. ==========================================================================
  1409.  
  1410. End of Resource Listing
  1411. -- 
  1412. Nick (Nikolaos) Fotis         National Technical Univ. of Athens, Greece
  1413. HOME: 16 Esperidon St.,       UUCP:    mcsun!ariadne!theseas!nfotis
  1414.       Halandri, GR - 152 32   or InterNet : nfotis@theseas.ntua.gr
  1415.       Athens, GREECE          FAX: (+30 1) 77 84 578
  1416.